Komponen biasa amikroskop pendarfluorialah:
Pewarna pendarfluor (fluorofor)
Fluorofor ialah sebatian pendarfluor yang memancarkan cahaya semula apabila teruja oleh cahaya.
Fluorofor biasanya mengandungi beberapa kumpulan aromatik terikat, atau molekul planar atau kitaran dengan beberapa ikatan π.
Banyak pewarna pendarfluor telah direka untuk banyak biomolekul.
Sebahagian daripada ini adalah molekul kecil yang sememangnya pendarfluor dan mengikat biomolekul yang diminati. Contoh utama ini ialah pewarnaan asid nukleik seperti DAPI dan Hoechst, phalloidin, yang digunakan untuk mengotorkan gentian aktin dalam sel mamalia.
sumber cahaya
Empat jenis sumber cahaya utama digunakan, termasuk lampu arka xenon atau lampu merkuri dengan penapis pengujaan, laser dan LED berkuasa tinggi.
Laser digunakan terutamanya dalam teknik mikroskop pendarfluor yang canggih, manakala lampu xenon, lampu merkuri dan LED dengan penapis pengujaan dichroic biasanya digunakan dalam mikroskop pendarfluor medan lebar.
Penapis pengujaan
Penguja lazimnya ialah penapis laluan jalur yang hanya melalui panjang gelombang yang diserap oleh pendarfluor, dengan itu meminimumkan pengujaan daripada sumber pendarfluor lain dan menyekat cahaya pengujaan dalam jalur pelepasan pendarfluor.
cermin dikroik
Penapis dichroic atau penapis filem nipis ialah penapis warna yang sangat tepat digunakan untuk memantulkan cahaya secara selektif dalam julat warna yang kecil sambil memantulkan warna lain.
Penapis pelepasan.
Pemancar biasanya merupakan penapis laluan jalur yang hanya melepasi panjang gelombang yang dipancarkan oleh fluorophore dan menyekat semua cahaya yang tidak diingini di luar jalur ini, terutamanya cahaya pengujaan.
Penapis memastikan latar belakang yang minimum dengan menapis tenaga pengujaan yang tidak diingini (termasuk UV dan IR) atau sampel dan sistem autofluoresensi.

